Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms