Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms