Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms