Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms