Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT140Q96RY7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms