Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD4Q96M96 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms