Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms