Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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