Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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GTF3C6Q969F1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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GTF3C6Q969F1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GTF3C6Q969F1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GTF3C6Q969F1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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GTF3C6Q969F1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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GTF3C6Q969F1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
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GTF3C6Q969F1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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GTF3C6Q969F1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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