Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms