Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms