Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms