Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU4

ALMS1, Alstrom syndrome protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1Q8TCU4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ALMS1Q8TCU4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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