Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms