Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SYT9Q86SS6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SYT9Q86SS6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SYT9Q86SS6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SYT9Q86SS6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SYT9Q86SS6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SYT9Q86SS6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SYT9Q86SS6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SYT9Q86SS6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SYT9Q86SS6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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