Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTW8

OTOA, Otoancorin, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOAQ7RTW8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOAQ7RTW8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOAQ7RTW8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms