Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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USP34Q70CQ2 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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USP34Q70CQ2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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USP34Q70CQ2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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USP34Q70CQ2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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USP34Q70CQ2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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USP34Q70CQ2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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USP34Q70CQ2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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