Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms