Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms