Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms