Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms