Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC27Q2M243 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms