Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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RTL8BQ17RB0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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