Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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