Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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GRIK5Q16478 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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GRIK5Q16478 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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GRIK5Q16478 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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