Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SSX1Q16384 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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