Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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