Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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