Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITSN1Q15811 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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