Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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