Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms