Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms