Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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