Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CHD4Q14839 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CHD4Q14839 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CHD4Q14839 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CHD4Q14839 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CHD4Q14839 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CHD4Q14839 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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CHD4Q14839 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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