Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SMCO1Q147U7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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