Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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