Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms