Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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