Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CAMK2DQ13557 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CAMK2DQ13557 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CAMK2DQ13557 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CAMK2DQ13557 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CAMK2DQ13557 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CAMK2DQ13557 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CAMK2DQ13557 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CAMK2DQ13557 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CAMK2DQ13557 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms