Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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