Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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