Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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