Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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