Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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