Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFRD2Q12894 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFRD2Q12894 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms