Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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EFEMP1Q12805 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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EFEMP1Q12805 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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EFEMP1Q12805 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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EFEMP1Q12805 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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EFEMP1Q12805 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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EFEMP1Q12805 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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