Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms