Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms