Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms