Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms